EAI는 협력적이고 발전적인 한일관계를 구축하기 위한 방안을 모색해오고 있다. 한일관계 관련 여론조사를 실시하고 토론회를 개최하며 세대 간 다양한 사람들의 목소리를 귀담아 듣고 있으며, 일본 관련 의제들에 대한 전문가들의 심층 분석을 논평, 스페셜 리포트, 단행본 등 다양한 형태의 결과물로 출간해오고 있다. 2013년부터 매년 일본의 겐론NPO와 공동으로 <한일 국민 상호인식 조사>를 실시하여 한일 양국의 당면한 현안에 대해 양국 국민의 평가와 의견을 조사하고 있으며, 그 결과를 바탕으로 양국 전문가 중심의 <한일미래대화>를 개최하여 한일 파트너십을 강화해가고 있다.